另一方面，原生动物对捕食细菌群落具有高度的选择性，即它们更喜欢捕食不能产生抗菌物质或产生抗菌物质能力较弱的细菌种群，从而使剩余细菌的群落与强力抗菌物质，可有效抵御其他致病菌的侵袭。值得注意的是，土壤微生物群落间的相互作用也与病原菌的入侵能力和植物健康密切相关。研究表明，免疫根际土壤微生物群落具有更高的多样性和更复杂的微生物相互作用网络。尤其值得注意的是，Li等人发现，根际竞争互动群落可以产生更多的抗菌物质，或充分占据根际有限的生态位，从而有效阻止病原菌的传播，预防土传病害的发生。然而，便利类植物群通过产生大量公共产品，为土传病原体的根际入侵提供了宝贵的资源，从而促进了疾病的爆发。因此，通过人工调控富集特定功能微生物群，培养特定功能微生物群，营造免疫型根际土壤微生态环境，是减少化学农药使用、改善土壤健康的新技术新方法。

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